Beberapa sekolah menyatakan mundur untuk mengikuti seleksi Adiwiyata Tingkat DIY pada tahun ini. Hal ini dikarenakan sarana prasana sekolah yang belum siap/ kurang memadahi, dan tidak adanya kegiatan siswa disekolah sebagai dampak Covid 19 dan administrasi untuk kelengkapan syarat masih banyak yang kurang. Mundurnya beberapa sekolah ini dari seleksi Adiwiyata Tingkat DIY diungkapkan dalam Rapat Koordinasi Rencana Pelaksanaan Evaluasi GPBLHS/Adiwiyata Tingkat DIY yang diadakan di RR Wonosadi Dinas Lingkungan Hidup Kabupaten Gunungkidul pada hari Selasa, 16 Juni 2020.
Program Adiwiyata akan dilaksanakan dengan mengacu kepada Peraturan Menteri Lingkungan Hidup dan Kehutanan Nomor 52 Tahun 2019 dan Peraturan Menteri Lingkungan Hidup dan Kehutanan Nomor 53 Tahun 2019. Pada pelaksanaannya, program tersebut akan tetap memperhatikan protokol kesehatan pencegahan penyebaran virus COVID-19.
Adapun untuk sekolah yang siap maju tahun ini diantaranya : MI Assalam, SD N Karangwuni dan SMA N 1 Karangmojo. Ketiga sekolah tersebut diharapkan untuk melengkapi berkas administrasi berupa softcopy dokumen EDS (Evaluasi Diri Sekolah), beserta lampiran dokumen pendukung dalam bentuk flashdisk paling lambat pada Senin tanggal 6 Juli 2020.